近年来，药物研究所共获批国家自然科学基金8项、省厅局级科研课题100余项、横向课题40余项；发表科研论文800余篇，其中110篇收录于SCI、EI、ISIP、Medline等核心数据库，500余篇为核心期刊论文。荣获陕西省科学技术奖二等奖、省高等学校科学技术奖一等奖、二等奖、省科技工作者创新创业大赛银奖等多项省部级奖项。授权国家发明专利36项、实用新型专利24项，其中已转让5项；研发医院制剂8项，开发天然产物功能产品10余项。