西安医学院药物研究所是我校首个设立的研究机构，在所长秦蓓教授带领下先后获批“省级优势学科”、“西安市重点实验室”及“西安市国际科技合作基地”。研究所现有药物活性分子的设计开发、药物分析与活性评价、药物新剂型与新技术的设计开发、天然活性成分的研究等科研方向，设立了药物化学合成创新平台、药物筛选与评价创新平台、药物分析测试创新平台、药物制剂实训创新平台。在优先满足教学工作的同时全力开展科学研究，以满足本科生及研究生人才培养的需求。

在学校的全力支持下，近年来先后获批陕西高校青年创新团队2个、校级科技创新团队2个、陕西省普通高校青年杰出人才3人、陕西省科技新星1人，省级三秦人才、重点学科带头人、科技新星、青年科技创新团队、新星人才等殊荣；荣获陕西省科学技术奖二等奖、省高等学校科学技术奖一等奖、二等奖、省科技工作者创新创业大赛银奖等多项省部级奖项；在团队共同努力下，获批国家自然科学基金8项、省厅局级科研课题100余项、横向课题40余项；发表科研论文800余篇，其中110篇收录于SCI、EI、ISIP、Medline等核心数据库，500余篇为核心期刊论文；授权国家发明专利36项、实用新型专利24项，其中已转让5项；研发医院制剂8项，开发天然产物功能产品10余项。

药物研究所依托重点实验室和省级优势学科已开展系统的理论知识学习、实践技能训练、大学生创新训练计划项目、学科竞赛、中国国际大学生创新大赛、综合设计性实验、毕业论文答辩等环节，学生能全面掌握药品质量控制、安全性评价、药物制备及指导合理用药等。学院本科生先后获批大学生创新实践项目128项，其中国家级41项、省级120项。在各类竞赛中，学生表现突出，荣获中国国际大学生创新大赛省级金奖、银奖、铜奖。在全国药学/中药学类专业实验技能大赛中，斩获特等奖1项、一等奖1项、二等奖2项。

  未来将继续深入开展产学研合作，推动科研成果市场化，推动建立以企业为主体、市场为导向，产学研深度融合的技术创新体系。